Hola,
No entiendo bien el problema, puesto que, al principio no querías añadir las subcarpetas, y, entonces, sobraba la línea de código referida arriba, o, a lo menos, la opción "soRecurse". Pero, ahora, dices que quieres añadir las subcarpetas... con lo cual tendrías que añadir la opción que antes quitaste...
Intuyo que te estás refiriendo a cómo se descomprime el archivo "Zip", esto es, a que se "recree" el árbol de carpetas o no. Creo que en este caso la solución no está en las opciones de compresión, sino en las de descompresión. No estoy seguro ahora mismo, ni puedo mirarlo, pero, revisa las opciones de descompresión: es ahí donde puedes optar porque se "recree" el árbol de carpetas o no.
También puede ser que esté completamente equivocado con lo que vengo diciendo. Si es así mis disculpas.
