No vamos a discutir ahora que es mejor windows o linux. Pero decir que usuarios pueden modificar un fichero es tan facil como pulsar con el boton derecho sobre el, propiedades, pestaña de seguridad y decir quien lo puede leer, escribir, etc ...
Y te puedo asegurar que se muy bien los quebraderos de cabeza que dan los programas en las cuentas limitadas, pero suelen ser programas antiguos no diseñados para XP, y nadie dijo que fuera facil pero si se quiere tener algun control sobre los equipos es necesario. En cuanto a la hora de instalarlos es normal que solo el administrador pueda instalar programas para eso es administrador
Lo dicho, no era por crear polemica, pero la respuesta de "...esto en linux seria muy facil ..." ya me la tienen dicho muchas veces. Y yo siempre respondo lo mismo, "... pero tenemos instalado windows asi que ¿que hacemos? ..."