Los archivos lck se crean en ambas carpetas. Se deben crear en el servidor para que Paradox sepa los registros que se estan editando en toda la red.
Primero borras los lck de las 2 ubicaciones, despues abres la session y despues conectas el TDabase, por último abres las tablas. En principio, al abrir una tabla, Delphi mira a que Session pertenece, si no tiene Session, mira en el TDatabase, por último conecta el TDatabase (todo lo hace automáticamente).
Ya puestos a borrar, borra tambien el archivo .NET del servidor al mismo tiempo de borrar los LCK, porque se queda en un corte de luz o apagados bruscos del sistema.
Para cerrar, al revés, primero cierras la Session y despues el TDatabase, Delphi lo hace automáticamente al destruir los objetos, si obtienes algún problema puedes añadirlo, total, son 2 lineas y aclaras el código
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Al usar el ConfigXP no notarás nada en especial, pero se sabe que hay que retocar esas propiedades del registro, Ians Marteens lo dice en su artículo "añadiendo estabilidad a Paradox".
Saludos