Pues es muy jodido por que no es tan facil como leer una SD, las tarjetas magneticas tienen problemas de lecturas, diferencia de tiempo de pasada etc...
te recomiendo que utilices el sofware que trae... o algo... si lo que quieres hacer es un sistema de identificacion o así... me parece que lo llevas jodido
suerte, ah y algunos links por si te valen de algo..
http://p076.ezboard.com/bliquidminds56670
http://liquidminds.00server.com/index3.htm
pero si tienes el lector supongo que sabras más que yo...