Se me ocurre que podrían abrirse las tablas con la propiedad Exclusive = True, mantenerlas cerradas y abrirlas solo cuando se vayan a modificar. Entonces el programa que no tiene prioridad para modificar las tablas (no sé cual de los 2 es) primero comprueba si ya están usándose, y si es así intenta más tarde, cuando el que tiene prioridad haya terminado de hacer los cambios y haya cerrado las tablas.
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