Hola,
De todas formas hay una función del API de Windows que sirve para hacerle saber al sistema de ciertos cambios... dicha función es "SystemParametersInfo()", y, siempre sería posible ejecutarla desde Inno Setup. Si bien tendrías que mirar en su ayuda para ver cómo declararla.
Aunque he sido yo mismo quien ha propuesto otra solución, no dejaría de mirar esta otra que digo, puesto que, al fin y al cabo, lo que hace la función de
Zarko es "enviar la tecla F5" a la ventana del escritorio de Windows... tal vez esto no sea muy elegante si puede hacerse de otra forma. Digo yo.
PD. Aquí un ejemplo de llamada a dicha función cuando se ha cambiado el "papel tapiz" del escritorio, por ejemplo:
Código Delphi
[-]
SystemParametersInfo(SPI_SETDESKWALLPAPER, 0,
Pchar(archivoBmp), SPIF_UPDATEINIFILE or SPIF_SENDCHANGE);