Es claro que componentes nativos funcionan mucho más rápido en las conexiones con las BD, yo hago pruebas en un server Drake con Firebird 1.5/FIB y anda mil puntos.
Tendrás tus razones para utilizar el BDE, pero si yo estaría en tu lugar buscaría alguna alternativa.
Quizás alguien con mas experiencia con BDE te de una mejor ayuda, pero como dicen en mi país: "esto es lo que tenemos"