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Te recomiendo una herramienta gratuíta llamada "PDf2Text"; Con ella podrás extraer (se puede llamar en línea de comandos utilizando parámetros) el texto del PDF a un fichero. Una vez en el fichero de texto ya podrás realizar la búsqueda de forma más cómoda.
Hace tiempo estuve con un tema similar y es la única opción quue encontré para acceder al texto de un PDF. Hablamos de soluciones gratuítas.
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