Yo tengo desarrollada en terminal server aplicaciones y no tengo este problema, creo que debe ser cuestión de permisos o de configuración de tu propio Windows, ojo, yo he manejado el 2003 server y no da este problemas con los servicios TS.
¿Has intentado probar tu software con un XP en conexión remota? el nucleo es el mismo en XP que en 2003 para servicios TS.
