Doy por supuesto que los botones bloqueados se encuentran en Form1. Además, si ya estás mostrando Form1, no es necesario la línea Form1.Show. También doy por supuesto que la frecuencia del Timer debe ser muy corta para dejar colgada la interfaz de la aplicación. En este caso puedes hacer lo que te ha dicho Neftalí. Si aún así no se soluciona el problema o deseas mantener la frecuencia del Timer bien corta, entonces te recomiendo que trabajes con Hilos (Threads) en tu aplicación. Esa es la mejor solución que puedes implementar. Pero es un trabajo que hay que hacerlo con un poco más de cuidado y trabajo.
Saludos!
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