Pues no acabo de enteder por qué te sucede a vos eso, ya que justamente uso tambien los componentes Zeos y tambien mi aplicacion se usa todo el día pero nunca he tenido tal problema.
Quizás la cosa sea por la configuarcion de la variable "wait_timeout" del archivo de Configuracion que usa el Servidor MySQL o tambien algunas otras variables que tenga que ver con la cuestion, tambien pueda que sea la version de MySQL que tienes( no has dicho que version de MySQL usas??)...
De todas forma la Variable
wait_timeout yo lo tengo con un valor de:
28800 por si te sirve de ayuda.
. Cabe mencionar que yo no he movido para nada tal configuarcion, por que en lo personal trabajo con el paquete
Xampp donde ya viene bien configuardo el servidor MySQL, Apache,PHP,etc.
Saludos...