El tema de la "basura", no suele ser problema, en un uso normal ni siquiera se notará. Por eso digo que no es problema, o al menos nunca me he encontrado que sea un problema en ningún caso.
También es cierto que además de los backups diarios, cada semana (cómo mínimo) tenemos programado un backup/restore de la BD (habitualmente los sábados por la noche o domingos, según el cliente), por lo que queda "limpia" para empezar a trabajar de nuevo con ella.
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