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Si es ubuntu, una LTS. Si es la versión server, mejor (aunque no tiene entorno gráfico).
Realmente prueba a instalar la que quieras, todas te van a funcionar bien, suse, debian, etc.
En mi trabajo sólo instalamos servidores linux, desde 1998, lo instalas, le pones firebird... y te olvidas.
Lo de probar tu programa windows en el linux... si no es imprescindible, mejor no. Puede funcionar con wine o con una máquina virtual, pero si va a hacer el equipo de servidor, pues que haga de servidor, no de cliente.
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