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El uso del índice es INDEPENDIENTE de si se emplea IN u OR.
Por lo general, y para cualquier motor de bases de datos, una consulta con IN es más lenta debido a que se requiere lanzar tantas subconsultas como criterios a evaluar dentro de IN existan. No es lo mismo, si se puede, enfocarlo desde una evaluación booleana como OR ya que el analizador detecta estos y puede optimizar mejor el proceso.
Internamente, de lo que vagamente tengo entendido y leído, Firebird tiene un árbol-AND-OR o algo por el estilo que le permite hacer evaluaciones y comprobaciones de una manera efectiva y puede filtrar los registros en la propia consulta. En cambio, cuando hay un IN se emite la misma consulta para cada valor a fin de determinar si corresponde o no filtrarlo.
Saludos,
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