Hola a todos!
Yo el tema de las copias de seguridad lo realizo en discos duros externos, pero tambien utilizo DropBox para subir copias en la nube. Ya que son dos cosas bien diferentes. Conceptualmente la nube tiene muchas ventajas, ya que fisicamente no esta en el mismo lugar, son centros de datos con muchas medidas de seguridad que ni en casa ni en la mayoria de empresas no hay. Tanto a nivel de seguridad pura y dura como a nivel de fallo (electrico, fisico, ect) Esto creo que añade un nivel de seguridad mucho mas alto.
Yo como tampoco me fio en el aspecto de que la información la tengan terceros, subo siempre las copias cifradas. Para ellos uso el programa freeware Cobian Backup. Que te permite automatizar las copias de seguridad y encriptarlas a un nivel 'muy alto'. Lo recomiendo para todo tipo de uso, no solo en la nube.
http://www.cobiansoft.com/index.htm
Respecto de dropbox me lo recomendo un compañero que se dedica a administrar sistemas y el me hablo bien del servicio. Tiene un sistema multiplataforma muy sencillo para subir los ficheros y tambien sirve para sincronizar carpetas entre equipos.