Una posible solución
Primero después de desinstalar postgrest se debe borrar el usuario de postgres de los usuarios del sistema por las herramientas administrativas y borrar del registro las llaves que crea para postgres pues queda basura de la instalación así se desinstale. Yo utilizo una herramienta que se llama inno setup y para la instalación silenciosa de postgres utilizo el siguiente script.
[Run]
Filename: {app}\postgresql-9.1.3-2-windows.exe; Parameters: --serverport 5432 --locale C --superaccount postgres --superpassword postgres --unattendedmodeui minimal --debuglevel 2 --mode unattended; StatusMsg: Aguarde mientra se instala la base de datos....
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