Hola, me parece que la solución es agregar DISTINCT después del SELECT, esto eliminará los registros duplicados del resultado de la consulta.
Código SQL
[-]SELECT DISTINCT resp_calif.id_exad,eva_maestro.nombre_examen,resp_calif.cedula,resp_calif.pregunta,resp_calif.respue sta,datos_personales.nombre,datos_personales.apellido,resp_calif.nota
FROM
resp_calif
INNER JOIN datos_personales ON datos_personales.cedula = resp_calif.cedula
INNER JOIN eva_maestro ON eva_maestro.id_exa = resp_calif.id_exad
Saludos.