La que yo prefiero y la que a lo largo de estos ańos ha resultado más efectiva (de las varias que he visto) ha sido la de validar la aplicación contra un servidor de Internet.
El problema es que tal vez para una versión inicial requiere demasiado trabajo/infraestructura.
Tal vez podrías empezar con un sistema de USUARIO/CLAVE/ID.VALIDACION. No es seguro 100% ni mucho menos, pero representa poco trabajo y para evitar copias sencillas como la que comentas será suficiente.
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