Gracias por la respuesta y la sugerencia anterior.
Mi base de datos es ISO-8859-1 y tenía mis dudas si, al grabar un XML firmado y después recuperarlo, éste seguiría siendo válido por el cambio de codificación.
Supongo que la mejor opción para grabar los XMLs firmados en la base de datos es comprimidos en un campo BLOB binario: me evito problemas de codificación y ahorro espacio.
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