No conozco el componente TSQLQuery, pero si se basa en TStrings, la longitud debe ser de 65536 caracteres (contando los cr/lf, claro).
Salvo que el motor al que te conectas tenga otra limitante... no veo por donde val el problema.. quizas ayude ver un fragmento de código de la asignación y saber como has comprobado que la consulta se corta.
Hasta luego.