Claro que si.
Supongo que se trata de una aplicación de escritorio, por lo tanto la cadena de conexión simplemente cambiará a algo como:
"example.com:/home/databases/database.fdb"
en el caso de un servidor corriendo linux, y si es windows a algo como:
"example.com:c:\databases\database.fdb".
Debes cuidar, si pones un firewall por delante de la bd, que este deje libre el tráfico por el puerto 3050.
Hasta luego.
