Se pueden programar consultas en Access (con JOIN's) y utilizando tablas de diferentes Bases de Datos; La sintaxis es la siguiente:
Código SQL
[-]SELECT FROM orders INNER JOIN items ON orders.OrderNo = items.OrderNo IN 'c:\temp\db1.mdb'
Si lo queires hacer utilizando el asuistente de consultas de Access, puedes hacerlo cambiando la Base de Datos activa en las propiedades de la consulta; Pr pasos:
(1) Vas al asistente y añades las tablas de la Bsse de Datos actual (vista diseño).
(2) Botón derecho sobre la zona gris del asistente.
(3) Accedes a propiedades y cambias la propiedad "Base de Datos de Origen" por la que quieras.
(4) Al cerrar las propiedades e intentar añadir tablas, te aparecerán las de la nueva Base de Datos que has añadido.