Hola
con esto vacias un combo:
Código PHP:
miCombo.length = 0;
y con esto metes nuevas opciones:
Código PHP:
miCombo.options[x] = new Option('texto', valor );
y si no recuerdo mal con esto puedes seleccionar una de las opciones
Código PHP:
miCombo.options[1].selected = true;
Todo, claro, en javascript. (no en php)