Nunca se puede generalizar, pero yo me inclino por una única Base de Datos. Depende en gran medida de lo que vayas a necesitar. Cuanta más compartición de datos exista entre las diferentes entidades (hoteles) más a cuenta te saldrá la solución de la Base de Datos única. Si hay poca cosa en común entre ellos tal vez la otra.
Piensa que no sólo es compartir determinadas tablas; En nuestro caso (que en diseño es similar) luego aparecen personas que deben tener acceso a diferentes Bases de Datos. Por decirte algo, hay un "Responsable de provincia" que tiene que tener acceso a todos los datos de los hoteles de su provincia. Luego hay una persona que debe acceder a datos estadísticos (de todas las entidades),... y así podría seguir y no acabaría.
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