Hola:
Sabes, yo he tenido problemas similares.
Lo que me han dicho es que el INNER JOIN realiza ordenamientos cartesianos complejos (mucha explicación para lo que puedo entender yo).
Yo he solucionado el problema utilizando LEFT OUTER JOIN.
Claro que no es lo mismo, pero así va rápido.
utilizando el IBExpert, realizando ambas consultas puedes ver la diferencia de lecturas que hay entre una opción y otra.
Aun aunque tenga creados los índices esto sucede siempre.
habría que ver como es que ordena las consultas con INNER JOIN el Firebird.
En un SQL 7 la misma consulta no tarda nada, por lo que seguramente las lecturas con uso de relaciones entre tablas las hacen distinto.
Estaría bueno que alguien con conocimientos nos ilumine en estas diferencias, pero yo ya he inentado en vano
