Hay algunos muchos paquetes de componentes que te ayudan en lo necesario para generar aplicaciones con licencia.
En
torry seguro que puedes encontrar varios.
Normalmente no hay que modificar el ejecutable; Lo normal es que se generen números de serie que tú das a tus clientes.
Hay muchas otras formas de protección, pero creo que esta es la estandard para comenzar.
Una vez que un cliente instala tu aplicación y hace el pago, le provees de la correspondiente clave y eso le permite ejecutar el programa.
Puedes buscar el los foros (busca por la palabra
PROTECCION). Es un tema que hemos tratado otras veces y encontrarás otros paquetes y otras opciones de proteccion.