[[duilioisola]]

Prueba con
...AutoFirma\AutoFirma.exe" sign -gui ...

De todos modos, en la instalación de Autofirma, existe el fichero
AutoFirmaCommandLine.exe
Ese es el que utilizo yo desde un bat que genero con todos los parámetros que necesito:

Código Delphi [-]
"sign.bat" = 

'"' + cPath + 'AutoFirma\AutoFirmaCommandLine.exe" sign ' +
// opcionalmente ' -gui ' +
'-i "' + DameTempPath + 'ToSign.xml' + '" ' +
'-o "' + DameTempPath + 'ToSign.xsig' + '" ' +
'-store windows -filter "subject.contains:' + PChar(cCert) + '" ' +
'-format facturae > "' + DameTempPath + 'sign_result.txt"';