Ya que el problema es de herramienta, prueba la de EMS:
http://www.sqlmanager.net/products/ibfb/manager
Tienen versiones gratis. Particularmente lo uso para firebird, ms-sql y postgress.
Y para reiterar, siendo que Sql Server es un motor excelente, no veo una justificacion real para hacer un cambio, mas bien es un problema de desconocimiento de los comandos particulares de firebird para hacer migracion de estructuras, algo que es muy poco usado.
Si fuera que firebird se corrompe, que fuera lento, que no tuviera una caracteristica X depronto ya se podria pensar en cambiar.