Hola, sabia decusión.
No es necesario que utilices ese transformador de access, el propio SQL Server contiene un agente que te traduce BBDD de diferentes naturalezasa otras tantas.
Lo aconsejable (es como yo trabajo) es utilizando con D6 las utilidades de la pestaña ADO y los store procedures (ya los verás en el SQL).
Por lo demás es armarte de paciencia y perder durante la curva de prendizaje (mínima) un poco el tmp hasta dominarlo.
Tienes que cambiar un poco la forma de pensar al trabajar con la filosofía cliente servidor, pero es facil realizarlo. Lo mejor es que práctiques con eemplos antes de acometer un proyecto de embergadura y a ser posible que al principio los usuarios trabjen de forma paralela con las dos aplicaciones al menos hasta comprobar que todo se ejecuta de forma correcta, ya que de todos es conocido que la fase de pruebas en el desarrollo del SW para quellas que desarrollamos proyectos para nuestra propia empresa es igual a la fase de explotación.
Suerte y bienvenido al club de los que vamos a triunfar.....