Existe una forma de cargar los datos de una tabla en un archivo txt con
LOAD DATA INFILE 'tabla.txt' into table tabla_mysql
Esto se encuentra en el manual de mysql
http://dev.mysql.com/doc/mysql/en/LOAD_DATA.html
Ahora no c porque no funciona, si la version de mysql que estoy utilizando es la 4.0.20 para NOVELL