No creo que sea el origen de tu problema, pero tengo entendido que el formato del archivo es diferente en diferentes sistemas operativos (al menos asi era en ib 6 y asi es en otras bases de datos), por lo que la forma correcta de migrarla sería hacer un backup (en transportable format) de la base de datos actual, y luego levantar el backup en la nueva base.
Hasta luego.
