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Lo aconsejable es hacer una backup tranportable (en windows) y restaurarla después en linux.
Ejemplo, en el windows hacemos el backup:
gbak -b -t -v -user sysdba -password masterkey tubase.fdb tubase.fbk
Luego en el linux restaurarmos el fbk
gbak -r -v -p 8192 -user sysdba -password masterkey tubase.fbk tubase.fdb
El -t es el parámetro que la convierte "transportable" para poder restaurarla en otro equipo.
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