[Ñuño Martínez]

Lo que pides no se puede hacer directamente con PHP, porque el lector está conectado en el cliente y PHP se ejecuta en el servidor.

Tal vez si el lector emula el funcionamiento del teclado puedas obtener su código a través de un campo < input >, como en el caso de los lectores de códigos de barras. De otro modo lo veo difícil.

[edito]Acabo de caer:

Tal vez con un plug-in en el cliente puedas obtener los datos a través de JavaScript o ActiveX (mejor si es JavaScript) y luego enviarlo mediante un formulario (< form >) oculto o utilizar el objeto XMLHttpRequest.