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Supongo que ese error te da al intentar activar la conexión con la Base de Datos (al abrir tablas o ejecutar consultas); Puedes probar a activar la conexión al principio y capturar (try..except) los errores que te de.
En ese punto deberías poder hacer varios reintentos con un breve lapso de tiempo entre medio, para "esperar" a que el servidor se arranque.
Otra cosa que puedes hacer es, al principio preguntar si el Servicio del servidor de FireBird está activo, sino es así esperar y volver a preguntar (repetir esto unas cuantas veces) antes de generar el error.
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