No se si la primera tabla es de SQL Server o de que SQL, en caso de que sea la primera opción podrías vincular la hoja de calculo de excel dentro del mismo gestor de BBDD con lo que podrías seguir utilizando la tabla independientemente y los datos serían accesibles desde las consultas de SQL Server.
https://msdn.microsoft.com/es-es/lib...=sql.110).aspx
Saludos