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Que te formatee la misma partición donde tienes el programa? Lo veo un poco difícil... Otra partición si seria posible, pero no puedes formatear la partición donde ejecutas tu programa desde ella misma. Has probado de hacer desde windows un "format c:"? Verás como no te deja.
Si quieres formatear tu partición donde tienes instalado el windows, no puedes hacerlo desde esta, es decir, ejecutando windows. Tendrias que ejecutar el programa antes de arrancar Windows, pero claro, eso es un poco dificil porque para interpretar un .exe necesitar Windows...
Hasta ahí donde yo se, que es muy poco...
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