Las mas usadas en el mercado considero que son Sql Server y Oracle.
Sql Server conviene para hacer aplicaciones de un almacenamiendo de datos medio, y oracle es para trabajar con grande volumenes de datos (Ojo no quiere decir que no puedas usar oracle para algo pequeño).
Lo mas importante es el manejo del lenguaje de consultas sql y conocer los derivados del mismo para cada motor como el Pl/sql de oracle o el transac sql de ms...
Yo por mi parte hago aplicaciones que no requieren grandes volumenes de información y utilizo interbase o firebird.
Cursos por la web existen muchisimos con solamente poner el nombre de la db en el google.
Saludos.
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