La lista de Alias de los certificados tambien se puede obtener dede la linea de comandos
Código:
AutofirmaCommandLine.exe listaaliases
Otra cosa:
Keys, podrias poner un enlace a la documentación de la que hablas.
Yo solo he localizado el manual de instalación de autofirma, pero no un detalle de los comandos aceptados.
Los paràmetros del final (Madrid), los pones a piñon fijo o es por que tu firmas desde Madrid?