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OPCIÓN 1:
Crear una columna oculta en el StriungGrid (Columm Width = 0) de forma que almacene 0 o 1; El valor de esa columna es el que te sirve para pintar diferente. Hace la función del Checkbox que quieres ańadir. Cada vez que pulsas en una fila cambias el valor de esa columna.
El pintado de un color u otro irá en relación a ese valor.
OPCIÓN 2:
Yo utilizaría una estructura anexa (por ejemplo un TList o TStrinsList -mejor este ordenado-) para guardar las filas que tienes seleccionadas.
(1) Al pulsar un Click, buscas si la fila está en la lista:
1a) Si está, borras ese indice de la lista
1b) Si no está, ańades ese índice a la lista
2) Repintar el Grid
En el pintado del grid, lo que tienes que hacer es pintar de diferente color los índices de la lista.
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