Respuesta fácil: Se identifica al personal en base al turno que pertenece.
Por ejemplo si el turno "nocturno" es de 23 a 7 y Pepito trabaja en dicho turno, cuando Pepito pase por el lector a las 23:05 sabrás que ha INGRESADO 5 minutos tarde, y para cuando lo pilles que se SALIÓ a las 6:48 ya sabes que le espera.
Ahora bien, si deseas complicarlo más y el personal va a estar saliendo y entrando, o pueden estar rotando de turno ya debes hacer un poquito más de esfuerzo. Lo fundamental: registrar cada movimiento.