Hola,
En cuanto a tu pregunta debo decir que podrías utlizar las condiciones de compilación, como bien dice el amigo Roman, pero recordá que sobre Kylix no se pueden ejecutar los .EXE conocidos de Window$ al ser un SO completamente diferente, por lo cuál deberías hacer un llamado el ShellExec del propio entorno (Libc.system) generando una línea de comandos para utilizar al Wine que emularía el uso de windows con tu app .EXE.
En la web de Borland tenés un artículo sobre ejecuciones externas:
http://community.borland.com/article...,27500,00.html
No sé si se entendió algo...