Me autocontesto y doy por cerrado el tema.
El problema venía por permisos de administración del equipo. Al ejecutar la aplicación como Administrador (os recuerdo que era en Windows 7), se han corregido todos los problemas, sin embargo, me quedo con la duda de porqué desde Delphi si lo ha podido completar.
En fin, lo dejo por si a alguien le sirve de ayuda alguna vez ;-)