Que tal... no se que tiempo llevas haciendo tus instaladores con Install Shield pero te aseguro que en mi momento tambien tuve inconvenientes, y pues te sugiero que hagas lo mismo que yo.... NO LO INTENTES MAS. No se para los demas pero me parece que la mejor solución es utilizar el Inno Setup.
http://www.jrsoftware.org/isinfo.php
Salu2