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Martita, para migrar datos de cualquier base de datos a Sql server, no hay nada mejor que los servicios de Transformación de datos (Mejor conocidos como DTS). Para crear Dts debes ir al administrador corporativo y buscar en tu servidor el item "Servicios de Transformación de Datos". y para generar tus primeras pruebas, podrías echar mano de los asistentes que Sql server incluye.
Queiro comentarte que las dts son sumamente útiles y potentes, para ejemplo, en la empresa las usamos para migrar datos desde Db2 en un As/400, Mysql, Access y hasta Excell.
Mucha suerte
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