Hola.
Aquí te puedes descargar varios ejemplos de Scripts de instalación de Firebird (para MSI, InstallShield, Inno Setup, ...)
http://ibinstall.defined.net/dl_scri...Source%20Files
Solo tienes que mezclar este Script con el Script de instalación de tu aplicación, para instalar conjuntamente la aplicación y Firebird.
Saludos.