Creo que el BDE tiene algunas lagunas con el manejo de memoria... te recomiendo que chequees que tenes instalada la última versión disponible (la 5.1 si no estoy mal).
Creo que no está de mas que también chequees tu codigo, para ver si no sos vos quien está "comiendo" memoria... sobre todo si trabajas con cgi's, donde tentativamente se crearán y destruirán muchas instancias de tus objetos. Si vas consumiendo recursos por allí... aunque sea unos cuantos bytes... la suma será una serie de caidas del servidor y problemas de memoria.
Es importante que siempre que crees un recurso, te asegures de liberarlo, incluso ante la ocurrencia de errores (Try Except o Try Finally), y también revisá tu manejo de multiples hilos de ejecución (si es tu caso).
Hasta luego.