Hola. Has verificado que el puerto que estas tratando de usar sea el por defecto (3306) o en la configuracion de la instancia del servidor le pusiste otro puerto (recuerda que te admite hasta el 3309, al menos no he probado con otros)
Si no es eso avisa y lo vemos, yo tengo varios servidores MySQL y este error viene casi siempre por el lado del puerto.
Saludos
Teo