Actualizar motor sqlite en android

[delphi.com.ar]

Por lo poco que vi, SqlExpert es un IDE/GUI para usar Sqlite, pero no un motor. De ser así, en tu caso dudo mas que SqlExpert corrompa el archivo a que que falle la libSqlite. Solo con el fin de probar, te recomiendo hacer lo siguiente

1. Modificar/editar el archivo en SqlExpert
2. Abrir el archivo generado con sqlite desde la consola.
3. Ejecutar .schema y copiar el resultado.

Si la consola falla, entonces SqlExpert no está haciendo algo bien, y el archivo no es compatible con libSqlite.
Si no falla, con ese resultado podrías generar la base datos desde cero desde la consola, garantizando compatibilidad.

Por otro lado, si SelExpert fuera un motor/librería/fork de sqlite, desconozco en Android, pero hablando del Linux, y considerando que uno es hijo del otro, capaz te sirva saber lo siguiente:
Sqlite es un motor de una librería única. o sea que funcionalmente es solo requiere un archivo en el sistema operativo. Esto implica que para que tu aplicativo pueda funcionar, solo debería encontrar en su search path, la librería esperada. Y como siempre el search path, se inicia por la ruta de ejecución, para " Actualizar motor sqlite", como dice el asunto del hilo, solo deberíamos copiar la librería en la ruta de instalación. Obviamente esto es exclusivo de nuestra aplicación.

Saludos.