¿Como analizar los archivos de una ruta recursivamente usando hilos?

[JoAnCa]

Hola a todos
Estoy creando una herramienta de limpieza de restos de virus, quisiera hacerla usando hilos para que funcione mas rápido, pero no estoy muy claro en como funciona el tema de los hilos

El algoritmo de mi herramienta es:
- Buscar recursivamente todos los archivos de la ruta especificada (en un hilo)
- Si el archivo es de las siguientes extensiones (.exe, .txt, .vbs o .lnk) pasarlo al proceso de análisis (otro hilo)
- Si cumple los patrones buscados agregarlo a una lista
- Después el usuario podrá seleccionarlos para eliminar los seleccionados o todos

No se si estará bien mi análisis, pero lo que quiero es que mientras se este analizando el archivo la búsqueda continúe.