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Sinceramente creo que tienes un poco de lío en la cabeza.
No tiene sentido crear una Base de Datos con varias Bases de Datos dentro como comentas. Deberías mirar algo de documentación sobre diseño de Bases de Datos; Creando un diseño con las relaciones entre tablas apropiadas tendrás lo que necesitas.
Necesitas un tabla de empresas y una tabla de equipos con una relación 1N hacia la tabla anterior. Eso te dará los N equipos que pertenecen a cada empresa.
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